Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms