Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms