Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms