Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms