Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc6F8VPZ5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms