Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp32F8VPZ3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms