Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms