Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LctF8VPT3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms