Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm3371F7CQW8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms