Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crocc2F6XLV1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms