Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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