Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms