Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P5

Gm3127, Predicted gene 3127, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3127E9Q9P5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3127E9Q9P5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms