Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms