Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms