Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3020E9Q3J7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3020E9Q3J7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm3020E9Q3J7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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