Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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