Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms