Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms