Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms