Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms