Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms