Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms