Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms