Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms