Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms