Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms