Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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