Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnldc1B2RXZ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms