Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms