Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms