Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms