Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
Abcc8B2RUS7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms