Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms