Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms