Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trabd2bB1ATG9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trabd2bB1ATG9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trabd2bB1ATG9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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