Protein–RNA interactions for Protein: A6X935

Itih4, Inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih4A6X935 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itih4A6X935 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itih4A6X935 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itih4A6X935 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itih4A6X935 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itih4A6X935 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itih4A6X935 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itih4A6X935 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itih4A6X935 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itih4A6X935 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itih4A6X935 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms