Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms