Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf39A2RT81 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf39A2RT81 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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