Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr4A2ARI4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr4A2ARI4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms