Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms