Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GabreA2AMW3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms