Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms