Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930447F04RikA2AFR2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms