Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a3A2ACT7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms