Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms