Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms