Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm2A2A7B5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm2A2A7B5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms