Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms