Protein–RNA interactions for Protein: A1Y9I9

Tomt, Transmembrane O-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TomtA1Y9I9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TomtA1Y9I9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms